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        行業(yè)資訊
        解碼生命有了國產(chǎn)利器
        發(fā)布時(shí)間:2019-05-27
            核心提示:2018年,深圳華大智造科技有限公司(以下簡稱“華大智造”)發(fā)布了一款我國自主研發(fā)的超高通量基因測序儀——“MGISEQ—T7”。這是目前全球單日生產(chǎn)能力最強(qiáng)的基因測序儀,其單日數(shù)據(jù)產(chǎn)量可達(dá)6TB,6臺(tái)機(jī)器可在1年內(nèi)完成10萬人的基因組測序工作,每GB數(shù)據(jù)的測序成本全球最低。

           基因序列的不同決定了生物多樣性和人在這個(gè)世界上的表現(xiàn)形式。解碼基因的奧秘,離不開先進(jìn)的基因測序儀器。然而,我國基因檢測產(chǎn)業(yè)仍處于跟跑階段,上游的測序儀器基本上依賴進(jìn)口,核心技術(shù)被少數(shù)外國企業(yè)把持。

          2018年,深圳華大智造科技有限公司(以下簡稱“華大智造”)發(fā)布了一款我國自主研發(fā)的超高通量基因測序儀——“MGISEQ—T7”。這是目前全球單日生產(chǎn)能力最強(qiáng)的基因測序儀,其單日數(shù)據(jù)產(chǎn)量可達(dá)6TB,6臺(tái)機(jī)器可在1年內(nèi)完成10萬人的基因組測序工作,每GB數(shù)據(jù)的測序成本全球最低。
         
          華大智造是全球第三家自主研發(fā)并量產(chǎn)臨床級高通量基因測序儀的公司,它是如何從無到有、從弱到強(qiáng)的?
         
          隨著測序技術(shù)的快速發(fā)展,基因測序在臨床和科研上都有著廣泛的應(yīng)用
         
          我們的生命來自于一個(gè)如針尖般微小的受精卵細(xì)胞,經(jīng)過50到60次的指數(shù)級復(fù)制,增至約100萬億個(gè)細(xì)胞。除極少數(shù)復(fù)制錯(cuò)誤,幾乎所有細(xì)胞里的DNA都完全一樣。
         
          DNA是由4種不同的堿基“A、T、C、G”根據(jù)不同的序列組成的雙螺旋結(jié)構(gòu)。如同“0、1”作為信息的基本單元一樣,“A、T、C、G”作為生命的“密碼”,為人類認(rèn)識生命打開了一扇大門。
         
          可是,人類基因組包含30億個(gè)堿基、約2.5萬多個(gè)基因,如果將這30億個(gè)堿基的序列印刷成冊,以每頁3000個(gè)印刷符號計(jì),將有100萬頁!
         
          上世紀(jì)90年代啟動(dòng)的人類基因組計(jì)劃,旨在通過測出人類基因組DNA的30億個(gè)堿基對的序列,破譯人類的全部遺傳信息。經(jīng)過10多年的努力,耗資30億美元,人類基因組計(jì)劃才宣告完成。
         
          之后,隨著測序技術(shù)的快速發(fā)展,基因測序的耗時(shí)和成本明顯下降。華大集團(tuán)執(zhí)行董事、華大智造首席執(zhí)行官牟峰告訴記者,如今,完成一個(gè)人的全基因組測序只需不到1天的時(shí)間,成本也只要不到600美元;驕y序的時(shí)代已經(jīng)到來。
         
          “基因測序技術(shù)在臨床和科研上有著廣泛的應(yīng)用。”華大智造首席運(yùn)營官蔣慧介紹,比如唐氏綜合征是我國發(fā)生率很高的出生缺陷之一,35歲以上的育齡婦女一般要做羊水穿刺來檢查染色體核型,但羊水穿刺有一定感染甚至流產(chǎn)的風(fēng)險(xiǎn)。采用基因測序技術(shù)可通過無創(chuàng)方式進(jìn)行唐氏綜合征等幾種染色體異常的篩查,能在低風(fēng)險(xiǎn)的條件下避免發(fā)生出生缺陷。
         
          專家介紹,臨床上可以通過檢查基因的序列,并與健康人的參數(shù)進(jìn)行對比,判斷這些序列是否改變,進(jìn)而找出可引起疾病的變異基因;相關(guān)技術(shù)在腫瘤治療、尋找傳染病致病原、指導(dǎo)個(gè)體化用藥等方面有明顯效果。
         
          華大集團(tuán)理事長楊煥明院士曾擔(dān)任國際人類基因組計(jì)劃中國協(xié)調(diào)人,他這樣評價(jià)基因測序的意義:有了人類基因組圖譜,人類對自身就會(huì)有比較全面的了解。了解了基因,就能找到新的診斷和治療疾病的方法。
         
          通過技術(shù)引進(jìn)和集成創(chuàng)新,把“黑鐵塔”轉(zhuǎn)化成桌面式產(chǎn)品
         
          就像信息處理離不開計(jì)算機(jī)一樣,大規(guī)模讀取生命“源代碼”需要先進(jìn)的技術(shù)設(shè)備。在基因測序產(chǎn)業(yè),作為上游基礎(chǔ)設(shè)施的基因測序儀,為相關(guān)應(yīng)用提供了關(guān)鍵的技術(shù)支撐,但它的生產(chǎn)制造難度極大。
         
          “基因測序儀是光學(xué)、機(jī)械、電子、流體、化學(xué)、物理、分子生物學(xué)、信息軟件等多學(xué)科的結(jié)合,測序儀的研發(fā)生產(chǎn),需要融合很多新技術(shù)。”牟峰說。
         
          人口基數(shù)大、大數(shù)據(jù)的應(yīng)用,是我國基因產(chǎn)業(yè)發(fā)展優(yōu)勢。近年來,我國基因測序市場發(fā)展迅速,但“重應(yīng)用、輕研發(fā)”傾向,使我國在測序儀研發(fā)領(lǐng)域上基本一片空白。
         
          與此同時(shí),個(gè)別外國企業(yè)在測序儀研發(fā)領(lǐng)域?qū)@姸,形成了?yán)密的保護(hù)體系,獲得了市場壟斷地位。華大基因一度是世界基因測序儀市場上的最大買家。
         
          轉(zhuǎn)折發(fā)生在2012年。當(dāng)時(shí)一直購買某國外品牌測序儀的華大基因忽然發(fā)現(xiàn),試劑耗材的報(bào)價(jià)一下漲了幾倍,不僅新儀器難以購買,廠家也不再維修舊儀器。
         
          華大智造執(zhí)行副總裁劉健說,我們雖然擁有很多進(jìn)口的測序儀,但對測序儀的處置卻沒有完全自主權(quán),國外廠商規(guī)定的一些條款也不合理。
         
          “我們曾希望將基因組計(jì)劃中獲得的技術(shù)和成果向醫(yī)學(xué)臨床轉(zhuǎn)化,但得不到儀器所屬企業(yè)的許可和支持。”蔣慧說。
         
          2013年,測序儀器制造商CG公司計(jì)劃出售。這家公司擁有先進(jìn)的生化測序原理和技術(shù),但彼時(shí)CG公司面臨困境:研發(fā)的超大型設(shè)備雖然擁有極高的通量,但每臺(tái)售價(jià)高達(dá)1200萬美元,極為昂貴,且與當(dāng)時(shí)技術(shù)應(yīng)用的趨勢不符,市場不買賬。
         
          抓住時(shí)機(jī),華大智造收購CG。“最初,我們拿到CG的樣機(jī)重達(dá)2噸,是個(gè)名副其實(shí)的‘黑鐵塔’。”蔣慧說,為了讓產(chǎn)品進(jìn)入更多研究機(jī)構(gòu)和臨床應(yīng)用,后來做了很多技術(shù)和理念上的轉(zhuǎn)變,把“黑鐵塔”轉(zhuǎn)化成了輕巧的桌面式產(chǎn)品。
         
          在此基礎(chǔ)上,華大智造持續(xù)創(chuàng)新:開發(fā)了DNA納米球、聯(lián)合探針錨定聚合技術(shù)和單管長片段建庫技術(shù);找到了萬里挑一的測序酶,使生化反應(yīng)時(shí)間縮短到1分鐘內(nèi)……
         
          依托自有技術(shù)路線,研發(fā)出一系列測序核心技術(shù)和產(chǎn)品,用戶擴(kuò)大到16個(gè)國家和地區(qū)
         
          目前,華大智造累計(jì)投入研發(fā)經(jīng)費(fèi)超過50億元,在一批關(guān)鍵核心技術(shù)上取得突破,實(shí)現(xiàn)了測序技術(shù)源頭式專利布局,申請技術(shù)專利580余項(xiàng),其中PCT專利80余項(xiàng)。此外,成功研發(fā)出相匹配的測序試劑、材料、生化反應(yīng)體系等一系列的核心技術(shù)和產(chǎn)品。
         
          “比如,在關(guān)鍵測序技術(shù)方面,傳統(tǒng)的PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))測序方法是把DNA雙鏈像筷子一樣分開,再用每根筷子去復(fù)制,1變2、2變4……最終完成指數(shù)級的擴(kuò)增。但這種方法也存在問題,只要一個(gè)環(huán)節(jié)出錯(cuò),后面都會(huì)出錯(cuò)。”華大智造測序儀產(chǎn)品經(jīng)理汪婧婧介紹,“我們研發(fā)的DNA片段滾環(huán)擴(kuò)增方式始終‘復(fù)印’的是原版DNA,就像用轉(zhuǎn)筆刀削鉛筆一樣,能有效消除擴(kuò)增錯(cuò)誤的積累,提高了測序的準(zhǔn)確度。”
         
          另一方面,華大智造研發(fā)了新一代單管長片段建庫技術(shù),可獲得長達(dá)300KB的長片段基因組信息,對于推動(dòng)高精度基因組測序在科研和產(chǎn)業(yè)領(lǐng)域應(yīng)用具有重要意義。
         
          依托自有技術(shù)路線,自2015年以來,華大智造基因測序儀的全球裝機(jī)量已超過1100臺(tái),覆蓋16個(gè)國家和地區(qū),用戶超過300家;發(fā)表高水平科研論文300余篇。哈佛醫(yī)學(xué)院基因組研究中心主任喬治·丘奇說:“有了核心技術(shù),華大智造能夠?qū)崿F(xiàn)測序價(jià)格可負(fù)擔(dān),且測序錯(cuò)誤率基本為零。”
         
          談及公司的創(chuàng)新基因,牟峰認(rèn)為:“我們成立3年,有員工近千人,研發(fā)人員比例超過50%。他們既有生命科學(xué)方面的專家,也有光學(xué)、機(jī)械等專業(yè)的人才,融合創(chuàng)新能力強(qiáng)。”
         
          目前,華大智造在上游儀器、試劑、軟件三方面均有研發(fā)和生產(chǎn)能力,這在國際上極為少有。2017年,華大智造與中科院長春光機(jī)所投資成立了長光華大基因測序設(shè)備(長春)有限公司,開展基因測序儀等儀器設(shè)備的研發(fā)生產(chǎn)。“我們相信跨界的技術(shù)應(yīng)用會(huì)改變這個(gè)行業(yè),高度重視技術(shù)在創(chuàng)新過程中的融合。”劉健說。
         
          “現(xiàn)代科技的發(fā)展實(shí)踐表明,誰在工具上率先實(shí)現(xiàn)了突破,誰就能獲得科技的先發(fā)優(yōu)勢。”牟峰說,“過去在很多領(lǐng)域我們都是跟隨,但是在生命科學(xué)時(shí)代,我們在一開始就與世界基本同步,所以更要盡快補(bǔ)齊關(guān)鍵核心技術(shù)短板,做出引領(lǐng)性的成果。”
         
          當(dāng)年,楊煥明和同事們參與了人類基因組計(jì)劃,并承擔(dān)了1%的測序任務(wù),就是這“1%”,使我國成為這一劃時(shí)代科學(xué)創(chuàng)舉中唯一的發(fā)展中國家。“‘1%測序項(xiàng)目’使我國具備自己的、接近世界水平的基因組的強(qiáng)大實(shí)力,相信我們通過進(jìn)一步的自主創(chuàng)新,將為21世紀(jì)生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展帶來光明和希望。”楊煥明說。
         
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